Masaüstü taramalı elektron mikroskobu odaklanmış bir elektron demeti tarafından numune yüzeyini tarayarak atomların yaydığı ikincil elektronlardan faydalanarak görüntü elde eden bir elektron mikroskobu türüdür.

Bu cihaz ile yüksek vakumda kuru ve iletken yüzeyleri incelemek mümkündür. Analizi yapılacak örneklerin morfolojik özellikleri merkezimizde bulunan JEOL NeoScope marka JMC-5000 model SEM cihazı ile belirlenebilmektedir. Analiz öncesinde numune çift yönlü karbon bir bant üzerine yerleştirilerek quorum kaplama cihazı ile Au/Pt kaplama işlemi gerçekleştirilir ve mikro boyuttaki katı numunelerin görüntülenmesi gerçekleştirilebilir.