Alınan su numuneleri, 1,5 - 2 litrelik cam şişe veya plastikten (polietilen) yapılmış numune kaplarına konur. Numune kaplarının çok temiz olmasına dikkat edilir. Numune alınacak şişe, alınacak su ile 4 - 5 defa yıkanır, su şişenin ağzına kadar doldurulur ve ağzı sıkıca kapatılır. Şişenin üzerine etiket yapıştırılır. Bu etiketlerin üzerine numuneyi alanın adı, numunenin alındığı yer ve tarih ile numune numarası yazılır. Alınan su numunesi gün içerisinde laboratuvara ulaştırılamıyorsa buzdolabında saklanır.

1. • Kaynaklardan Numune Alma ;Kaynaklarda özellikle küçük debili olanlarda suyun çıktığı noktada iyice temizlenmiş bir beton veya demir boru zemine sokulmalıdır.Büyük debili ve göllenmiş kaynaklarda dipteki gözlerden birine iyice temizlenmiş, sivri uçlu ve ucundan itibaren santimetrik kısımda delikler bulunan yeterli uzunlukta demir bir boru saplanır. Bu borudan 15-20 dakika su akıtıldıktan sonra numune alınır.
2. • Akarsulardan Numune Alma ;Sulama bölgesi civarından, suyun durgun halde olmayan hareket halindeki kısımlardan alınmasına dikkat edilmelidir.
   • Baraj Gölleri ve Doğal Göllerden Numune Alma; Suyun barajı ve gölü terkettiği yerlerden hareket halindeki kısımlardan alınır.
   • Kuyulardan Numune Alma; Kuyulardan su numunesi alınmasında pompanın bir müddet çalıştırılmasından pompa içindeki ve borularda bulunan suların dışarı tamamen atılmasından 15-20 dakika sonra alınmasına dikkat edilmelidir.