İdari Birimler
- Genel Sekreterlik
- Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
- İdari ve Mali İşler Daire Başkanlığı
- Kütüphane ve Dokümantasyon Daire Başkanlığı
- Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
- Personel Daire Başkanlığı
- Sağlık, Kültür ve Spor Daire Başkanlığı
- Strateji Geliştirme Daire Başkanlığı
- Yapı İşleri ve Teknik Daire Başkanlığı
- Hukuk Müşavirliği
- Basın ve Halkla İlişkiler Müdürlüğü
- Döner Sermaye İşletme Müdürlüğü
Koordinatörlükler
- Akademik Gelişim Koordinatörlüğü
- Balıkesir Üniversitesi Kalite Güvencesi, Kalite Komisyonu ve Kalite Koordinatörlüğü
- Balıkesir Üniversitesi Radyo Koordinatörlüğü
- Balıkesir Üniversitesi Tanıtım ve Sosyal Medya Koordinatörlüğü
- Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü
- Bilimsel Yayınlar ve Dergiler Koordinatörlüğü
- Bologna Koordinatörlüğü
- Dijital Dönüşüm Koordinatörlüğü
- Eğiticilerin Eğitimi Koordinatörlüğü
- Enerji Yönetimi ve Sürdürülebilirlik Koordinatörlüğü
- Engelsiz Üniversite Koordinatörlüğü
- Farabi Değişim Programı Kurum Koordinatörlüğü
- İç Denetim Birimi Koordinatörlüğü
- İş Sağlığı ve Güvenliği Koordinatörlüğü
- Kişisel Verileri Koruma Koordinatörlüğü
- Meslek Yüksekokulları Uygulamalı Eğitim (3+1) Koordinatörlüğü
- Meslek Yüksekokulları Koordinatörlüğü
- Mezun İstihdam Ofisi Koordinatörlüğü
- Öğretim Üyesi Yetiştirme Programı Kurum Koordinatörlüğü
- Proje Destek, Girişimcilik ve İnovasyon Koordinatörlüğü
- Spor Dostu Kampüs Koordinatörlüğü
- Tazelenme Üniversitesi Projesi Koordinasyon Ofisi Koordinatörlüğü
- Teknoloji Transfer Ofisi Koordinatörlüğü
- Topluma Katkı Koordinatörlüğü
- Uluslararası İlişkiler Genel Koordinatörlüğü
- Uygulama ve Araştırma Merkezleri İzleme ve Değerlendirme Koordinatörlüğü
- 1416 Yurtdışı Bursluluğu Koordinatörlüğü
